Syntéza, Modifikácie a Degradácia Bielkovín: Prehľad
Ťukni na otočenie · Potiahni na navigáciu
66 kartičiek
Otázka: Čo katalyzuje vznik peptidovej väzby počas translácie u prokaryotov?
Odpoveď: Peptidyl transferáza (ribozym v rRNA) katalyzuje nukleofilnú adíciu aminoskupiny na karbonylovú skupinu peptidylovej tRNA, tvorbu peptidovej väzby a u
Otázka: Aké sú hlavné elongačné faktory u prokaryotov a aká je ich funkcia?
Odpoveď: EF-Tu (vstup aminoacyl‑tRNA do A miesta, viaže sa s GTP), EF-Ts (resyntéza GTP pre EF-Tu) a EF-G (translokáz a, posun ribozómu po mRNA).
Otázka: Ako EF‑Tu sprostredkúva vstup aminoacyl‑tRNA do A miesta?
Odpoveď: EF‑Tu viazaný na GTP sa naviaže na aminoacyl‑tRNA; hydrolýza GTP na GDP + P umožní vstup a naviazanie komplexu EF‑Tu–aminoacyl‑tRNA na ribozóm.
Otázka: Akú úlohu má EF‑G pri elongácii?
Odpoveď: EF‑G sa viaže pri A mieste, hydrolýza GTP mení jeho konformáciu a umožní translokáciu (posun) ribozómu po mRNA, prenášajúc peptidyl‑tRNA z A do P mies
Otázka: Čo sa deje s tRNA pri pohybe z P do E miesta?
Odpoveď: Pohyb tRNA z P do E miesta narušuje párovanie báz medzi tRNA a mRNA, čo vedie k disociácii voľnej (deacylovanej) tRNA.
Otázka: Aká je rýchlosť proteosyntézy u prokaryotov?
Odpoveď: Približne 55 aminokyselín za sekundu.
Otázka: Kedy dochádza k terminácii proteosyntézy a čo sa pri tom deje?
Odpoveď: Terminácia nastáva, keď do A miesta vstúpi stop kodón (UAG, UAA alebo UGA). Uvoľňovací faktor sa naviaže na stop kodón a hydrolyzuje väzbu medzi posle
Otázka: Ktoré uvoľňovacie faktory rozpoznávajú stop kodóny u prokaryotov a čo robí RF‑3?
Odpoveď: RF1 rozpoznáva UAG a UAA; RF2 rozpoznáva UAA a UGA; RF3 je G‑proteín homologický EF‑Tu a sprostredkúva interakcie medzi RF1/RF2 a ribozómom.
Otázka: Aký je mechanizmus uvoľňovacieho faktora pri terminácii?
Odpoveď: Uvoľňovací faktor má v štruktúre viazanú vodu podobnú tRNA, vnáša ju do peptidového miesta, kde voda podlieha hydrolýze a uvoľní sa polypeptid.
Otázka: Koľko makroergických väzieb sa spotrebuje na vznik jednej peptidovej väzby (energetická bilancia) u prokaryotov?
Odpoveď: Aktivácia AMK: 2 ~P viazaní (ATP → AMP + PPi); iniciácia: 1 GTP; elongácia: 2 GTP (EF‑Tu a EF‑G); terminácia: 1 GTP (RF‑3). Spolu: 1 ATP → AMP + 4 GTP