Intermediárny metabolizmus
Klíčové pojmy: Intermediárny metabolizmus spája katabolizmus a anabolizmus cez spoločné medziprodukty, NADH a FADH2 napájajú dýchací reťazec; NADPH slúži pre biosyntézy, Oxidačná fosforylácia závisí na O2; substrátová fosforylácia nie vždy, Pyruvát je kľúčový uzol: môže ísť na acetyl-CoA, laktát alebo glukoneogenézu, Citrátový cyklus poskytuje NADH, FADH2, GTP a prekurzory biosyntéz, Pentózový cyklus (PPP) generuje NADPH a ribózu-5-P pre nukleotidy, Regulácia: hormóny (inzulín/glukagón), allosteria (citrát, ATP, AMP) a enzýmová kontrola (PDH, PFK-1, ACC), Orgánovo špecifický metabolizmus: svaly (glykogén, laktát), srdce (MK preferované), tuk (TAG skladovanie), Hladovanie presúva metabolizmus k lipolýze a ketogenéze; mozog sa adaptuje na ketolátky, Cesta glukózy v bunke: Glc -> Glc-6-P -> glykolýza / PPP / glykogenéza, Prebytočné mastné kyseliny sa ukladajú ako TAG a využívajú sa pre syntézy lipidových signálnych molekúl, Anaplerotické reakcie dopĺňajú CC a umožňujú biosyntetické odvody
## Úvod
Intermediárny metabolizmus sa zaoberá integračnými väzbami medzi katabolickými a anabolickými dráhami, hlavnými medziproduktmi a mechanizmami získavania a rozdeľovania energie v bunke. Materiál nižšie rozkladá hlavné princípy, kľúčové dráhy, ich reguláciu a príklady využitia v orgánoch.
> Definícia: Intermediárny metabolizmus je súbor biochemických dráh, ktoré interkonvertujú malé molekuly (cukry, mastné kyseliny, aminokyseliny, nukleotidy) a koordinujú získavanie, skladovanie a spotrebu energie v bunke.
## Základné pojmy a princípy
### Energie a prenášače elektrónov
- Hlavné prenášače elektrónov: **NADH + H+**, **FADH2** a **NADPH** (pre redukčné biosyntézy).
- Oxidácia substrátov vedie k prenosu redukčných ekvivalentov na dýchací reťazec a k syntéze ATP cez oxidačnú fosforyláciu.
> Definícia: Oxidačná fosforylácia je proces, pri ktorom sa energia uvoľnená prenosom elektrónov na kyslík využije na vytvorenie protónového gradientu a následnú syntézu ATP.
### Dve základné cesty vzniku ATP
1. **Oxidačná fosforylácia** (mitochondrie): elektróny z NADH/FADH2 -> dýchací reťazec -> O2, vznik protónového gradientu -> ATP syntáza.
2. **Substrátová fosforylácia**: prenos fosfátovej skupiny z vysokoenergetickej medziproduktu priamo na ADP (napr. 1,3-bisfosfoglycerát -> 3-fosfoglycerát, PEP -> pyruvát; alebo sukcinyl-CoA -> sukcinát s GTP produkciou).
### Kľúčové medziprodukty (prehľad)
- Glukóza a jej fosfáty: **Glc, Glc-6-P, Glc-1-P, Fru-6-P, Fru-1,6-bisP**
- Glykolýza: **GAP (glyceraldehyd-3-P), 1,3-BPG, 3-PG, PEP, pyruvát**
- Pyruvát → **acetyl-CoA** (PDH reakcia)
- Citrátový cyklus: **citrát, izocitrát, 2-oxoglutarát, sukcinyl-CoA, sukcinát, fumarát, malát, oxaloacetát**
- Lipidový metabolizmus: **acetyl-CoA, malonyl-CoA, palmitoyl-CoA, TAG, MK**
- Pentózový cyklus: **Rib-5-P, NADPH**
- Nukleotidy a porfyríny: **CTP, UTP, GTP, 5-ALA, PBG, hem**
## Hlavné metabolické cesty (prehľad a prepojenia)
### Glykolýza a osud glukózy
- Glukóza je v bunke viazaná ako Glc-6-P. Pečeň má glukóza-6-fosfatázu a môže uvoľniť voľnú glukózu do obehu.
- Glc-6-P môže:
- vstúpiť do glykolýzy na tvorbu ATP a NADH,
- vstúpiť do pentózo-fosfátovej cesty na tvorbu NADPH a ribózy-5-P,
- byť konvertovaná na acetyl-CoA a ďalej sa použiť na tvorbu tukov,
- byť uložená ako glykogén.
> Definícia: Pentózový fosfátový put (PPP) generuje NADPH pre biosyntézy a ribózu-5-fosfát pre syntézu nukleotidov.
### Pyruvát a acetyl-CoA
- Pyruvát môže byť oxidovaný PDH komplexom na acetyl-CoA (vstup do CC) alebo redukovan na laktát pri anaeróbnych podmienkach.
- Acetyl-CoA je centrálny metabolit: zdroj energie (CC), východiskový substrát pre syntézu MK, cholesterol, ketolátky.
### Citrátový cyklus (CC)
- Úplná oxidácia acetyl-CoA vedie k tvorbe CO2, NADH, FADH2 a GTP.
- Niektoré deriváty CC slúžia ako prekurzory pre glukoneogenézu a biosyntézy (anaplerotické a kataplerotické reakcie).
### Lipidy: syntéza a odbúravanie
- Syntéza MK vyžaduje **NADPH** a prekurzor **malonyl-CoA**; vznik TAG v tukovom tkanive.
- Beta-oxidácia MK vedie k tvorbe acetyl-CoA, NADH a FADH2.
- Pri hladovaní: akumulácia ketolátok v pečeni z ac-CoA; extrahepatálne tkanivá (napr. mozog v dlhodobom hladovaní) môžu používať ketolátky.
Fun fact: Mozog nemá zásoby glukózy a pri dlhom hladovaní môže používať 0-hydroxybutyr�t (ketolátky) ako zdroj energie, pretože sa premenia na acetyl-CoA.
### Aminokyseliny a ich osud (prepojenie na CC)
- Deaminované AK sa konvertujú na pyruvát, acetyl-CoA alebo intermediáty CC (oxaloacetát, 2-oxoglutarát, sukcinyl-CoA), ktoré sa ďalej oxidujú alebo používajú na biosyntézy.
- Ureagenéza (pečeň) odstraňuje prebytočný amoniak ako močovinu (ornitínový cyklus).
## Regulácia metabolizmu (prehľad mechanizmov)
- Hormonálna kontrola: inzulín (anabolizmus: glykogenéza, lipogenéza), glukagón (katabolizmus: glukoneogenéza, glykogenolýza). Pokles glykemie znižuje sekréciu inzulínu a zvyšuje sekréciu glukagónu.
- Allosterická regulácia: napr. fruktóza-2,6-bisP regu