Tarjetas de Evolución Molecular: Teoría Neutra y Coalescente

Evolución Molecular: Teoría Neutra y Coalescente para estudiantes

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¿Qué dos procesos se superponen para construir la variación hereditaria actual en una muestra según la explicación de coalescencia?

La superposición del proceso de coalescente y el proceso de mutación.

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Coalescencia

22 tarjetas

Tarjeta 1

Pregunta: ¿Qué dos procesos se superponen para construir la variación hereditaria actual en una muestra según la explicación de coalescencia?

Respuesta: La superposición del proceso de coalescente y el proceso de mutación.

Tarjeta 2

Pregunta: ¿Cómo se calcula el tiempo de coalescencia de toda la muestra?

Respuesta: Se calcula de forma recursiva (usando probabilidades de coalescencia condicionales a tiempos anteriores).

Tarjeta 3

Pregunta: En un modelo con N individuos diploides, ¿cuántos alelos hay en el pool de la población?

Respuesta: Hay 2N alelos (cada individuo aporta dos alelos).

Tarjeta 4

Pregunta: En el modelo descrito, ¿qué supuesto se hace sobre la contribución de gametas de los individuos al pool?

Respuesta: Se supone que cada individuo contribuye la misma cantidad de gametas a un pool efectivamente infinito, de modo que las frecuencias relativas de alelos

Tarjeta 5

Pregunta: Si en ese pool infinito tomo una muestra de un alelo y luego tomo otra gameta al azar, ¿cuál es la probabilidad de que sea el mismo alelo?

Respuesta: La probabilidad es 1/(2N), porque todos los alelos están igualmente representados.

Tarjeta 6

Pregunta: ¿Cuál es la probabilidad de que no haya coalescencia entre dos muestreos de alelos en una generación?

Respuesta: Es el complemento: 1 − 1/(2N).

Tarjeta 7

Pregunta: ¿Cómo se expresa la probabilidad de que la coalescencia ocurra exactamente en el tiempo t (en generaciones) en términos de no coalescencia previa y co

Respuesta: Es la probabilidad de no coalescencia en todas las generaciones anteriores ( (1 − 1/(2N))^(t−1) ) multiplicada por la probabilidad de coalescencia en

Tarjeta 8

Pregunta: ¿Qué es el tiempo de coalescencia en el contexto poblacional descrito en el texto?

Respuesta: Es el tiempo en el que los linajes alélicos encuentran un ancestro común; puede ser mayor o menor que el tiempo de separación poblacional según pérdid

Tarjeta 9

Pregunta: ¿Cómo afecta la pérdida aleatoria de alelos al tiempo de coalescencia respecto al tiempo de separación poblacional?

Respuesta: La pérdida aleatoria de alelos puede hacer que el tiempo de coalescencia sea menor que el tiempo de separación poblacional.

Tarjeta 10

Pregunta: En condiciones sin pérdida de alelos, cómo se espera que sea el tiempo de coalescencia en relación con la separación de poblaciones?

Respuesta: Se espera que el tiempo de coalescencia sea mayor que el tiempo de separación poblacional, que es lo que suele ocurrir en general.