Prepis DNA: Mechanizmy a Regulácia – Detailný Rozbor pre Študentov
Ťukni na otočenie · Potiahni na navigáciu
18 kartičiek
Otázka: Z ktorých podjednotiek sa skladá bakteriálna RNA polymeráza a čo robia α a ω podjednotky?
Odpoveď: RNA polymeráza obsahuje päť podjednotiek: dve α, ω, β, β' a σ. Podjednotky α a ω udržujú stabilitu celej molekuly RNA polymerázy.
Otázka: Aká je funkcia podjednotky β v bakteriálnej RNA polymeráze?
Odpoveď: Podjednotka β obsahuje oblasť, ktorá katalyzuje tvorbu fosfodiesterovej väzby v reťazci RNA.
Otázka: Akú úlohu má podjednotka β' v RNA polymeráze?
Odpoveď: β' sa podieľa na roztváraní DNA duplexu a pripojení RNA polymerázy k templátovému reťazcu DNA.
Otázka: Prečo je σ (sigma faktor) dôležitý pri transkripcii prokaryotov?
Odpoveď: σ faktor je nevyhnutný pre iniciáciu, pretože prostredníctvom neho sa RNA polymeráza viaže na správny promótor (okolo -35 nukleotidu).
Otázka: Kde sa nachádza promótor vzhľadom na štartovací nukleotid a aký je jeho obsah báz?
Odpoveď: Promótor sa nachádza vľavo od štartovacieho nukleotidu vo vzdialenosti niekoľkých desiatok bázových párov; oblasť promotora je bohatá na AT bázy.
Otázka: Z ktorých dvoch konzervovaných motívov sa skladá prokaryotický promótor a aké sú ich sekvencie?
Odpoveď: Promótor obsahuje Pribnowovu sekvenciu okolo -10 s TATAAT a oblasť okolo -35 so sekvenciou TTGACA.
Otázka: Čo znamená, že promótor je „silnejší“?
Odpoveď: Silnejší promótor má vyššiu afinitu k RNA polymeráze, čo závisí od toho, aké podobné sú jeho -10 a -35 sekvencie ku konsenzuálnym sekvenciám.
Otázka: Ako prebieha iniciácia transkripcie v prokaryotoch?
Odpoveď: σ podjednotka naväzuje RNA polymerázu na promótor v oblasti -35 a pokrýva aj -10 (Pribnowovu) oblasť; následne β podjednotka katalyzuje vznik prvej fo
Otázka: Aká je zvyčajná prvá transkribovaná báza mRNA a aké je jej typické okolie?
Odpoveď: Prvá báza mRNA je zvyčajne adenín, často ohraničený dvoma pyrimidínmi (najčastejšie sekvencia CAT). Niekedy to môže byť guanín, takmer nikdy nie pyrim
Otázka: V ktorom smere a akou rýchlosťou prebieha syntéza mRNA v prokaryotoch?
Odpoveď: Syntéza mRNA prebieha v smere 5'→3' rýchlosťou približne 40 bp za sekundu.